Protein–RNA interactions for Protein: O08638

Myh11, Myosin-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh11O08638 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Myh11O08638 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Myh11O08638 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Myh11O08638 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Myh11O08638 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Myh11O08638 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Myh11O08638 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Myh11O08638 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Myh11O08638 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Myh11O08638 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Myh11O08638 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Myh11O08638 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Myh11O08638 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Myh11O08638 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Myh11O08638 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Myh11O08638 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Myh11O08638 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Myh11O08638 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Myh11O08638 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Myh11O08638 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Myh11O08638 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Myh11O08638 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Myh11O08638 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Myh11O08638 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Myh11O08638 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Myh11O08638 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Myh11O08638 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Myh11O08638 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Myh11O08638 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Myh11O08638 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Myh11O08638 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Myh11O08638 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Myh11O08638 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Myh11O08638 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Myh11O08638 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Myh11O08638 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Myh11O08638 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Myh11O08638 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Myh11O08638 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Myh11O08638 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Myh11O08638 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Myh11O08638 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Myh11O08638 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Myh11O08638 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Myh11O08638 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Myh11O08638 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Myh11O08638 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Myh11O08638 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Myh11O08638 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Myh11O08638 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Myh11O08638 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Myh11O08638 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Myh11O08638 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Myh11O08638 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Myh11O08638 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Myh11O08638 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Myh11O08638 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Myh11O08638 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Myh11O08638 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Myh11O08638 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Myh11O08638 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Myh11O08638 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Myh11O08638 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Myh11O08638 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Myh11O08638 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Myh11O08638 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Myh11O08638 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Myh11O08638 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Myh11O08638 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Myh11O08638 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Myh11O08638 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Myh11O08638 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Myh11O08638 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Myh11O08638 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Myh11O08638 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Myh11O08638 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Myh11O08638 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Myh11O08638 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Myh11O08638 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Myh11O08638 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Myh11O08638 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Myh11O08638 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Myh11O08638 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Myh11O08638 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Myh11O08638 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Myh11O08638 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Myh11O08638 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Myh11O08638 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Myh11O08638 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Myh11O08638 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Myh11O08638 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Myh11O08638 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Myh11O08638 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Myh11O08638 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Myh11O08638 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Myh11O08638 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Myh11O08638 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Myh11O08638 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Myh11O08638 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Myh11O08638 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms