Protein–RNA interactions for Protein: G3X9I7

Zc3h12b, MCG2522, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h12bG3X9I7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zc3h12bG3X9I7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zc3h12bG3X9I7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zc3h12bG3X9I7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zc3h12bG3X9I7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Zc3h12bG3X9I7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zc3h12bG3X9I7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zc3h12bG3X9I7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zc3h12bG3X9I7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zc3h12bG3X9I7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zc3h12bG3X9I7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zc3h12bG3X9I7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zc3h12bG3X9I7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zc3h12bG3X9I7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zc3h12bG3X9I7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zc3h12bG3X9I7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zc3h12bG3X9I7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zc3h12bG3X9I7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zc3h12bG3X9I7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zc3h12bG3X9I7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zc3h12bG3X9I7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zc3h12bG3X9I7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zc3h12bG3X9I7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zc3h12bG3X9I7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zc3h12bG3X9I7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zc3h12bG3X9I7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zc3h12bG3X9I7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zc3h12bG3X9I7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Zc3h12bG3X9I7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zc3h12bG3X9I7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Zc3h12bG3X9I7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zc3h12bG3X9I7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zc3h12bG3X9I7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zc3h12bG3X9I7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zc3h12bG3X9I7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zc3h12bG3X9I7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zc3h12bG3X9I7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zc3h12bG3X9I7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zc3h12bG3X9I7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zc3h12bG3X9I7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zc3h12bG3X9I7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zc3h12bG3X9I7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zc3h12bG3X9I7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zc3h12bG3X9I7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zc3h12bG3X9I7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zc3h12bG3X9I7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zc3h12bG3X9I7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zc3h12bG3X9I7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zc3h12bG3X9I7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zc3h12bG3X9I7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zc3h12bG3X9I7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zc3h12bG3X9I7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zc3h12bG3X9I7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Zc3h12bG3X9I7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zc3h12bG3X9I7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zc3h12bG3X9I7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zc3h12bG3X9I7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zc3h12bG3X9I7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zc3h12bG3X9I7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zc3h12bG3X9I7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zc3h12bG3X9I7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zc3h12bG3X9I7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zc3h12bG3X9I7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zc3h12bG3X9I7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Zc3h12bG3X9I7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zc3h12bG3X9I7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zc3h12bG3X9I7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zc3h12bG3X9I7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Zc3h12bG3X9I7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zc3h12bG3X9I7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zc3h12bG3X9I7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zc3h12bG3X9I7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Zc3h12bG3X9I7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zc3h12bG3X9I7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zc3h12bG3X9I7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zc3h12bG3X9I7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zc3h12bG3X9I7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zc3h12bG3X9I7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zc3h12bG3X9I7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zc3h12bG3X9I7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zc3h12bG3X9I7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zc3h12bG3X9I7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zc3h12bG3X9I7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zc3h12bG3X9I7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zc3h12bG3X9I7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Zc3h12bG3X9I7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zc3h12bG3X9I7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zc3h12bG3X9I7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zc3h12bG3X9I7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zc3h12bG3X9I7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zc3h12bG3X9I7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zc3h12bG3X9I7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zc3h12bG3X9I7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zc3h12bG3X9I7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zc3h12bG3X9I7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zc3h12bG3X9I7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zc3h12bG3X9I7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zc3h12bG3X9I7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Zc3h12bG3X9I7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Zc3h12bG3X9I7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms