Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Nccrp1G3X9C2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nccrp1G3X9C2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nccrp1G3X9C2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nccrp1G3X9C2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nccrp1G3X9C2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nccrp1G3X9C2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nccrp1G3X9C2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nccrp1G3X9C2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nccrp1G3X9C2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nccrp1G3X9C2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nccrp1G3X9C2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nccrp1G3X9C2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nccrp1G3X9C2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nccrp1G3X9C2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nccrp1G3X9C2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nccrp1G3X9C2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nccrp1G3X9C2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nccrp1G3X9C2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nccrp1G3X9C2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nccrp1G3X9C2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nccrp1G3X9C2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nccrp1G3X9C2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nccrp1G3X9C2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nccrp1G3X9C2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nccrp1G3X9C2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nccrp1G3X9C2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nccrp1G3X9C2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nccrp1G3X9C2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nccrp1G3X9C2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nccrp1G3X9C2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nccrp1G3X9C2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Nccrp1G3X9C2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nccrp1G3X9C2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nccrp1G3X9C2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nccrp1G3X9C2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nccrp1G3X9C2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nccrp1G3X9C2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nccrp1G3X9C2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Nccrp1G3X9C2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Nccrp1G3X9C2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nccrp1G3X9C2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nccrp1G3X9C2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nccrp1G3X9C2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Nccrp1G3X9C2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Nccrp1G3X9C2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nccrp1G3X9C2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nccrp1G3X9C2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nccrp1G3X9C2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nccrp1G3X9C2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nccrp1G3X9C2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nccrp1G3X9C2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nccrp1G3X9C2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nccrp1G3X9C2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nccrp1G3X9C2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Nccrp1G3X9C2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Nccrp1G3X9C2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nccrp1G3X9C2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nccrp1G3X9C2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nccrp1G3X9C2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Nccrp1G3X9C2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Nccrp1G3X9C2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nccrp1G3X9C2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nccrp1G3X9C2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nccrp1G3X9C2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nccrp1G3X9C2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nccrp1G3X9C2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nccrp1G3X9C2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Nccrp1G3X9C2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nccrp1G3X9C2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nccrp1G3X9C2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nccrp1G3X9C2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nccrp1G3X9C2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nccrp1G3X9C2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nccrp1G3X9C2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nccrp1G3X9C2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nccrp1G3X9C2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nccrp1G3X9C2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nccrp1G3X9C2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nccrp1G3X9C2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nccrp1G3X9C2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nccrp1G3X9C2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nccrp1G3X9C2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nccrp1G3X9C2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nccrp1G3X9C2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nccrp1G3X9C2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nccrp1G3X9C2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nccrp1G3X9C2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nccrp1G3X9C2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nccrp1G3X9C2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nccrp1G3X9C2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nccrp1G3X9C2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nccrp1G3X9C2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nccrp1G3X9C2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nccrp1G3X9C2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nccrp1G3X9C2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nccrp1G3X9C2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nccrp1G3X9C2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nccrp1G3X9C2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nccrp1G3X9C2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms