Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ07

5830473C10Rik, RIKEN cDNA 5830473C10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5830473C10RikF8VQ07 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
5830473C10RikF8VQ07 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
5830473C10RikF8VQ07 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
5830473C10RikF8VQ07 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
5830473C10RikF8VQ07 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
5830473C10RikF8VQ07 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
5830473C10RikF8VQ07 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
5830473C10RikF8VQ07 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
5830473C10RikF8VQ07 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
5830473C10RikF8VQ07 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
5830473C10RikF8VQ07 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
5830473C10RikF8VQ07 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
5830473C10RikF8VQ07 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
5830473C10RikF8VQ07 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
5830473C10RikF8VQ07 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
5830473C10RikF8VQ07 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
5830473C10RikF8VQ07 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
5830473C10RikF8VQ07 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
5830473C10RikF8VQ07 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
5830473C10RikF8VQ07 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
5830473C10RikF8VQ07 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
5830473C10RikF8VQ07 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
5830473C10RikF8VQ07 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
5830473C10RikF8VQ07 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
5830473C10RikF8VQ07 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
5830473C10RikF8VQ07 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
5830473C10RikF8VQ07 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
5830473C10RikF8VQ07 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
5830473C10RikF8VQ07 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
5830473C10RikF8VQ07 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
5830473C10RikF8VQ07 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
5830473C10RikF8VQ07 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
5830473C10RikF8VQ07 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
5830473C10RikF8VQ07 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
5830473C10RikF8VQ07 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
5830473C10RikF8VQ07 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
5830473C10RikF8VQ07 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
5830473C10RikF8VQ07 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
5830473C10RikF8VQ07 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
5830473C10RikF8VQ07 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
5830473C10RikF8VQ07 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
5830473C10RikF8VQ07 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
5830473C10RikF8VQ07 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
5830473C10RikF8VQ07 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
5830473C10RikF8VQ07 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
5830473C10RikF8VQ07 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
5830473C10RikF8VQ07 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
5830473C10RikF8VQ07 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
5830473C10RikF8VQ07 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
5830473C10RikF8VQ07 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
5830473C10RikF8VQ07 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22■■□□□ 1.11
5830473C10RikF8VQ07 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
5830473C10RikF8VQ07 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
5830473C10RikF8VQ07 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
5830473C10RikF8VQ07 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
5830473C10RikF8VQ07 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
5830473C10RikF8VQ07 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
5830473C10RikF8VQ07 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
5830473C10RikF8VQ07 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
5830473C10RikF8VQ07 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
5830473C10RikF8VQ07 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
5830473C10RikF8VQ07 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
5830473C10RikF8VQ07 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
5830473C10RikF8VQ07 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
5830473C10RikF8VQ07 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
5830473C10RikF8VQ07 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
5830473C10RikF8VQ07 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
5830473C10RikF8VQ07 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
5830473C10RikF8VQ07 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
5830473C10RikF8VQ07 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
5830473C10RikF8VQ07 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
5830473C10RikF8VQ07 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
5830473C10RikF8VQ07 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
5830473C10RikF8VQ07 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
5830473C10RikF8VQ07 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
5830473C10RikF8VQ07 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
5830473C10RikF8VQ07 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
5830473C10RikF8VQ07 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
5830473C10RikF8VQ07 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
5830473C10RikF8VQ07 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
5830473C10RikF8VQ07 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
5830473C10RikF8VQ07 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
5830473C10RikF8VQ07 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
5830473C10RikF8VQ07 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
5830473C10RikF8VQ07 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
5830473C10RikF8VQ07 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
5830473C10RikF8VQ07 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
5830473C10RikF8VQ07 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
5830473C10RikF8VQ07 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
5830473C10RikF8VQ07 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
5830473C10RikF8VQ07 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
5830473C10RikF8VQ07 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
5830473C10RikF8VQ07 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
5830473C10RikF8VQ07 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
5830473C10RikF8VQ07 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
5830473C10RikF8VQ07 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
5830473C10RikF8VQ07 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
5830473C10RikF8VQ07 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
5830473C10RikF8VQ07 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
5830473C10RikF8VQ07 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms