Protein–RNA interactions for Protein: F8VPK8

Pcdh9, Protocadherin 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh9F8VPK8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcdh9F8VPK8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcdh9F8VPK8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcdh9F8VPK8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcdh9F8VPK8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcdh9F8VPK8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcdh9F8VPK8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcdh9F8VPK8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcdh9F8VPK8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcdh9F8VPK8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcdh9F8VPK8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcdh9F8VPK8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcdh9F8VPK8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcdh9F8VPK8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcdh9F8VPK8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcdh9F8VPK8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcdh9F8VPK8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcdh9F8VPK8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcdh9F8VPK8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcdh9F8VPK8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcdh9F8VPK8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcdh9F8VPK8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcdh9F8VPK8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcdh9F8VPK8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcdh9F8VPK8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcdh9F8VPK8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcdh9F8VPK8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcdh9F8VPK8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcdh9F8VPK8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcdh9F8VPK8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcdh9F8VPK8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcdh9F8VPK8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcdh9F8VPK8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcdh9F8VPK8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcdh9F8VPK8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcdh9F8VPK8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcdh9F8VPK8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcdh9F8VPK8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcdh9F8VPK8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcdh9F8VPK8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcdh9F8VPK8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcdh9F8VPK8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcdh9F8VPK8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcdh9F8VPK8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcdh9F8VPK8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcdh9F8VPK8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcdh9F8VPK8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcdh9F8VPK8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcdh9F8VPK8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcdh9F8VPK8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcdh9F8VPK8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcdh9F8VPK8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcdh9F8VPK8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcdh9F8VPK8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcdh9F8VPK8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcdh9F8VPK8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcdh9F8VPK8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcdh9F8VPK8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcdh9F8VPK8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcdh9F8VPK8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcdh9F8VPK8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcdh9F8VPK8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcdh9F8VPK8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcdh9F8VPK8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcdh9F8VPK8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcdh9F8VPK8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcdh9F8VPK8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pcdh9F8VPK8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pcdh9F8VPK8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcdh9F8VPK8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcdh9F8VPK8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcdh9F8VPK8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcdh9F8VPK8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcdh9F8VPK8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcdh9F8VPK8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcdh9F8VPK8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcdh9F8VPK8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcdh9F8VPK8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcdh9F8VPK8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcdh9F8VPK8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcdh9F8VPK8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcdh9F8VPK8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcdh9F8VPK8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcdh9F8VPK8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcdh9F8VPK8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcdh9F8VPK8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcdh9F8VPK8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcdh9F8VPK8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcdh9F8VPK8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcdh9F8VPK8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcdh9F8VPK8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcdh9F8VPK8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcdh9F8VPK8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcdh9F8VPK8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcdh9F8VPK8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcdh9F8VPK8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcdh9F8VPK8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcdh9F8VPK8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcdh9F8VPK8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pcdh9F8VPK8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms