Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
H2-M1F7CXU4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2-M1F7CXU4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2-M1F7CXU4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2-M1F7CXU4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2-M1F7CXU4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2-M1F7CXU4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2-M1F7CXU4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2-M1F7CXU4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
H2-M1F7CXU4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2-M1F7CXU4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2-M1F7CXU4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2-M1F7CXU4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2-M1F7CXU4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2-M1F7CXU4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2-M1F7CXU4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2-M1F7CXU4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2-M1F7CXU4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2-M1F7CXU4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2-M1F7CXU4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
H2-M1F7CXU4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
H2-M1F7CXU4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2-M1F7CXU4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2-M1F7CXU4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2-M1F7CXU4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2-M1F7CXU4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2-M1F7CXU4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-M1F7CXU4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-M1F7CXU4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-M1F7CXU4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-M1F7CXU4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-M1F7CXU4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-M1F7CXU4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-M1F7CXU4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-M1F7CXU4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-M1F7CXU4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-M1F7CXU4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-M1F7CXU4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-M1F7CXU4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-M1F7CXU4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-M1F7CXU4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-M1F7CXU4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-M1F7CXU4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-M1F7CXU4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
H2-M1F7CXU4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2-M1F7CXU4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2-M1F7CXU4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2-M1F7CXU4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
H2-M1F7CXU4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2-M1F7CXU4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2-M1F7CXU4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2-M1F7CXU4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2-M1F7CXU4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2-M1F7CXU4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2-M1F7CXU4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
H2-M1F7CXU4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2-M1F7CXU4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-M1F7CXU4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-M1F7CXU4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-M1F7CXU4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-M1F7CXU4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-M1F7CXU4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-M1F7CXU4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-M1F7CXU4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-M1F7CXU4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2-M1F7CXU4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
H2-M1F7CXU4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2-M1F7CXU4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2-M1F7CXU4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2-M1F7CXU4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2-M1F7CXU4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2-M1F7CXU4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2-M1F7CXU4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2-M1F7CXU4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2-M1F7CXU4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2-M1F7CXU4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
H2-M1F7CXU4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
H2-M1F7CXU4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
H2-M1F7CXU4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
H2-M1F7CXU4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2-M1F7CXU4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
H2-M1F7CXU4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2-M1F7CXU4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2-M1F7CXU4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2-M1F7CXU4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2-M1F7CXU4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2-M1F7CXU4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2-M1F7CXU4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
H2-M1F7CXU4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
H2-M1F7CXU4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
H2-M1F7CXU4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
H2-M1F7CXU4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
H2-M1F7CXU4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
H2-M1F7CXU4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
H2-M1F7CXU4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
H2-M1F7CXU4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
H2-M1F7CXU4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
H2-M1F7CXU4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
H2-M1F7CXU4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
H2-M1F7CXU4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms