Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm28038F7BCN9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm28038F7BCN9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm28038F7BCN9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm28038F7BCN9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm28038F7BCN9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm28038F7BCN9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm28038F7BCN9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm28038F7BCN9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm28038F7BCN9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm28038F7BCN9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm28038F7BCN9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm28038F7BCN9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm28038F7BCN9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm28038F7BCN9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm28038F7BCN9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm28038F7BCN9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm28038F7BCN9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm28038F7BCN9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm28038F7BCN9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm28038F7BCN9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm28038F7BCN9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm28038F7BCN9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm28038F7BCN9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm28038F7BCN9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm28038F7BCN9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm28038F7BCN9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm28038F7BCN9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm28038F7BCN9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm28038F7BCN9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm28038F7BCN9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm28038F7BCN9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm28038F7BCN9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm28038F7BCN9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm28038F7BCN9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm28038F7BCN9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm28038F7BCN9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm28038F7BCN9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm28038F7BCN9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm28038F7BCN9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm28038F7BCN9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm28038F7BCN9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm28038F7BCN9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm28038F7BCN9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm28038F7BCN9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm28038F7BCN9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm28038F7BCN9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm28038F7BCN9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm28038F7BCN9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm28038F7BCN9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm28038F7BCN9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm28038F7BCN9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm28038F7BCN9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm28038F7BCN9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm28038F7BCN9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm28038F7BCN9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm28038F7BCN9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm28038F7BCN9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm28038F7BCN9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm28038F7BCN9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm28038F7BCN9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm28038F7BCN9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm28038F7BCN9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm28038F7BCN9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm28038F7BCN9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm28038F7BCN9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Gm28038F7BCN9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm28038F7BCN9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm28038F7BCN9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm28038F7BCN9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm28038F7BCN9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm28038F7BCN9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm28038F7BCN9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm28038F7BCN9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm28038F7BCN9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm28038F7BCN9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm28038F7BCN9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm28038F7BCN9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm28038F7BCN9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm28038F7BCN9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm28038F7BCN9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm28038F7BCN9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gm28038F7BCN9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm28038F7BCN9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm28038F7BCN9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm28038F7BCN9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm28038F7BCN9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm28038F7BCN9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm28038F7BCN9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm28038F7BCN9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm28038F7BCN9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm28038F7BCN9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm28038F7BCN9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm28038F7BCN9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm28038F7BCN9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm28038F7BCN9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm28038F7BCN9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm28038F7BCN9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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