Protein–RNA interactions for Protein: F6VRN1

Smgc, Submandibular gland protein C (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmgcF6VRN1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SmgcF6VRN1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SmgcF6VRN1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SmgcF6VRN1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SmgcF6VRN1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SmgcF6VRN1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SmgcF6VRN1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SmgcF6VRN1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SmgcF6VRN1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SmgcF6VRN1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SmgcF6VRN1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SmgcF6VRN1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SmgcF6VRN1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SmgcF6VRN1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SmgcF6VRN1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SmgcF6VRN1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SmgcF6VRN1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SmgcF6VRN1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SmgcF6VRN1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SmgcF6VRN1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SmgcF6VRN1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SmgcF6VRN1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SmgcF6VRN1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SmgcF6VRN1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SmgcF6VRN1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SmgcF6VRN1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SmgcF6VRN1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SmgcF6VRN1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SmgcF6VRN1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SmgcF6VRN1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SmgcF6VRN1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SmgcF6VRN1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SmgcF6VRN1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SmgcF6VRN1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SmgcF6VRN1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SmgcF6VRN1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SmgcF6VRN1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SmgcF6VRN1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SmgcF6VRN1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SmgcF6VRN1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SmgcF6VRN1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SmgcF6VRN1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SmgcF6VRN1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SmgcF6VRN1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SmgcF6VRN1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SmgcF6VRN1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SmgcF6VRN1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SmgcF6VRN1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SmgcF6VRN1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SmgcF6VRN1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SmgcF6VRN1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SmgcF6VRN1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SmgcF6VRN1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SmgcF6VRN1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SmgcF6VRN1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SmgcF6VRN1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SmgcF6VRN1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SmgcF6VRN1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SmgcF6VRN1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SmgcF6VRN1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SmgcF6VRN1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SmgcF6VRN1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SmgcF6VRN1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SmgcF6VRN1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SmgcF6VRN1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SmgcF6VRN1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SmgcF6VRN1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SmgcF6VRN1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SmgcF6VRN1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SmgcF6VRN1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SmgcF6VRN1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SmgcF6VRN1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SmgcF6VRN1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SmgcF6VRN1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SmgcF6VRN1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SmgcF6VRN1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SmgcF6VRN1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SmgcF6VRN1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SmgcF6VRN1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SmgcF6VRN1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SmgcF6VRN1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SmgcF6VRN1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SmgcF6VRN1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SmgcF6VRN1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SmgcF6VRN1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SmgcF6VRN1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SmgcF6VRN1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SmgcF6VRN1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SmgcF6VRN1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SmgcF6VRN1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SmgcF6VRN1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SmgcF6VRN1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SmgcF6VRN1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SmgcF6VRN1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SmgcF6VRN1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SmgcF6VRN1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SmgcF6VRN1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SmgcF6VRN1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SmgcF6VRN1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SmgcF6VRN1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms