Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Syngap1F6SEU4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Syngap1F6SEU4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Syngap1F6SEU4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Syngap1F6SEU4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Syngap1F6SEU4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Syngap1F6SEU4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Syngap1F6SEU4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Syngap1F6SEU4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Syngap1F6SEU4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Syngap1F6SEU4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Syngap1F6SEU4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Syngap1F6SEU4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Syngap1F6SEU4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Syngap1F6SEU4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Syngap1F6SEU4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Syngap1F6SEU4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Syngap1F6SEU4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Syngap1F6SEU4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Syngap1F6SEU4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Syngap1F6SEU4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Syngap1F6SEU4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Syngap1F6SEU4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Syngap1F6SEU4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Syngap1F6SEU4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Syngap1F6SEU4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Syngap1F6SEU4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Syngap1F6SEU4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Syngap1F6SEU4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Syngap1F6SEU4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Syngap1F6SEU4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Syngap1F6SEU4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Syngap1F6SEU4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Syngap1F6SEU4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Syngap1F6SEU4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Syngap1F6SEU4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Syngap1F6SEU4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Syngap1F6SEU4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Syngap1F6SEU4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Syngap1F6SEU4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Syngap1F6SEU4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Syngap1F6SEU4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Syngap1F6SEU4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Syngap1F6SEU4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Syngap1F6SEU4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Syngap1F6SEU4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Syngap1F6SEU4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Syngap1F6SEU4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Syngap1F6SEU4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Syngap1F6SEU4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Syngap1F6SEU4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Syngap1F6SEU4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Syngap1F6SEU4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Syngap1F6SEU4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Syngap1F6SEU4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Syngap1F6SEU4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Syngap1F6SEU4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Syngap1F6SEU4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Syngap1F6SEU4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Syngap1F6SEU4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Syngap1F6SEU4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Syngap1F6SEU4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Syngap1F6SEU4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Syngap1F6SEU4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Syngap1F6SEU4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Syngap1F6SEU4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Syngap1F6SEU4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Syngap1F6SEU4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Syngap1F6SEU4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Syngap1F6SEU4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Syngap1F6SEU4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Syngap1F6SEU4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Syngap1F6SEU4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Syngap1F6SEU4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Syngap1F6SEU4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Syngap1F6SEU4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Syngap1F6SEU4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Syngap1F6SEU4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Syngap1F6SEU4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Syngap1F6SEU4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Syngap1F6SEU4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Syngap1F6SEU4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Syngap1F6SEU4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Syngap1F6SEU4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Syngap1F6SEU4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Syngap1F6SEU4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Syngap1F6SEU4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Syngap1F6SEU4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Syngap1F6SEU4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Syngap1F6SEU4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Syngap1F6SEU4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Syngap1F6SEU4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Syngap1F6SEU4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Syngap1F6SEU4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Syngap1F6SEU4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Syngap1F6SEU4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Syngap1F6SEU4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Syngap1F6SEU4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Syngap1F6SEU4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Syngap1F6SEU4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 189.5 ms