Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q2

R3hdm1, R3H domain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3hdm1E9Q9Q2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
R3hdm1E9Q9Q2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
R3hdm1E9Q9Q2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
R3hdm1E9Q9Q2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
R3hdm1E9Q9Q2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
R3hdm1E9Q9Q2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
R3hdm1E9Q9Q2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
R3hdm1E9Q9Q2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
R3hdm1E9Q9Q2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
R3hdm1E9Q9Q2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
R3hdm1E9Q9Q2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
R3hdm1E9Q9Q2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
R3hdm1E9Q9Q2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
R3hdm1E9Q9Q2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
R3hdm1E9Q9Q2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
R3hdm1E9Q9Q2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
R3hdm1E9Q9Q2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
R3hdm1E9Q9Q2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
R3hdm1E9Q9Q2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
R3hdm1E9Q9Q2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
R3hdm1E9Q9Q2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
R3hdm1E9Q9Q2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
R3hdm1E9Q9Q2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
R3hdm1E9Q9Q2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
R3hdm1E9Q9Q2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
R3hdm1E9Q9Q2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
R3hdm1E9Q9Q2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
R3hdm1E9Q9Q2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
R3hdm1E9Q9Q2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
R3hdm1E9Q9Q2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
R3hdm1E9Q9Q2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
R3hdm1E9Q9Q2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
R3hdm1E9Q9Q2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
R3hdm1E9Q9Q2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
R3hdm1E9Q9Q2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
R3hdm1E9Q9Q2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
R3hdm1E9Q9Q2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
R3hdm1E9Q9Q2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
R3hdm1E9Q9Q2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
R3hdm1E9Q9Q2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
R3hdm1E9Q9Q2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
R3hdm1E9Q9Q2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
R3hdm1E9Q9Q2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
R3hdm1E9Q9Q2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
R3hdm1E9Q9Q2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
R3hdm1E9Q9Q2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
R3hdm1E9Q9Q2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
R3hdm1E9Q9Q2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
R3hdm1E9Q9Q2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
R3hdm1E9Q9Q2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
R3hdm1E9Q9Q2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
R3hdm1E9Q9Q2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
R3hdm1E9Q9Q2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
R3hdm1E9Q9Q2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
R3hdm1E9Q9Q2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
R3hdm1E9Q9Q2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
R3hdm1E9Q9Q2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
R3hdm1E9Q9Q2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
R3hdm1E9Q9Q2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
R3hdm1E9Q9Q2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
R3hdm1E9Q9Q2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
R3hdm1E9Q9Q2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
R3hdm1E9Q9Q2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
R3hdm1E9Q9Q2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
R3hdm1E9Q9Q2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
R3hdm1E9Q9Q2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
R3hdm1E9Q9Q2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
R3hdm1E9Q9Q2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
R3hdm1E9Q9Q2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
R3hdm1E9Q9Q2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
R3hdm1E9Q9Q2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
R3hdm1E9Q9Q2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
R3hdm1E9Q9Q2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
R3hdm1E9Q9Q2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
R3hdm1E9Q9Q2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
R3hdm1E9Q9Q2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
R3hdm1E9Q9Q2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
R3hdm1E9Q9Q2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
R3hdm1E9Q9Q2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
R3hdm1E9Q9Q2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
R3hdm1E9Q9Q2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
R3hdm1E9Q9Q2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
R3hdm1E9Q9Q2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
R3hdm1E9Q9Q2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
R3hdm1E9Q9Q2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
R3hdm1E9Q9Q2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
R3hdm1E9Q9Q2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
R3hdm1E9Q9Q2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
R3hdm1E9Q9Q2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
R3hdm1E9Q9Q2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
R3hdm1E9Q9Q2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
R3hdm1E9Q9Q2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
R3hdm1E9Q9Q2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
R3hdm1E9Q9Q2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
R3hdm1E9Q9Q2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
R3hdm1E9Q9Q2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
R3hdm1E9Q9Q2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
R3hdm1E9Q9Q2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
R3hdm1E9Q9Q2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
R3hdm1E9Q9Q2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms