Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L6

4930579F01Rik, RIKEN cDNA 4930579F01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930579F01RikE9Q3L6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930579F01RikE9Q3L6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930579F01RikE9Q3L6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930579F01RikE9Q3L6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930579F01RikE9Q3L6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930579F01RikE9Q3L6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930579F01RikE9Q3L6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930579F01RikE9Q3L6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930579F01RikE9Q3L6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930579F01RikE9Q3L6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930579F01RikE9Q3L6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930579F01RikE9Q3L6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930579F01RikE9Q3L6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930579F01RikE9Q3L6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930579F01RikE9Q3L6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930579F01RikE9Q3L6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930579F01RikE9Q3L6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930579F01RikE9Q3L6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930579F01RikE9Q3L6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4930579F01RikE9Q3L6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
4930579F01RikE9Q3L6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
4930579F01RikE9Q3L6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4930579F01RikE9Q3L6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4930579F01RikE9Q3L6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
4930579F01RikE9Q3L6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
4930579F01RikE9Q3L6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
4930579F01RikE9Q3L6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
4930579F01RikE9Q3L6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
4930579F01RikE9Q3L6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
4930579F01RikE9Q3L6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4930579F01RikE9Q3L6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4930579F01RikE9Q3L6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4930579F01RikE9Q3L6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4930579F01RikE9Q3L6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4930579F01RikE9Q3L6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
4930579F01RikE9Q3L6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930579F01RikE9Q3L6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930579F01RikE9Q3L6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930579F01RikE9Q3L6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930579F01RikE9Q3L6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930579F01RikE9Q3L6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930579F01RikE9Q3L6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930579F01RikE9Q3L6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930579F01RikE9Q3L6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930579F01RikE9Q3L6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930579F01RikE9Q3L6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
4930579F01RikE9Q3L6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4930579F01RikE9Q3L6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4930579F01RikE9Q3L6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4930579F01RikE9Q3L6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4930579F01RikE9Q3L6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4930579F01RikE9Q3L6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4930579F01RikE9Q3L6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
4930579F01RikE9Q3L6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
4930579F01RikE9Q3L6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
4930579F01RikE9Q3L6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4930579F01RikE9Q3L6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4930579F01RikE9Q3L6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4930579F01RikE9Q3L6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4930579F01RikE9Q3L6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
4930579F01RikE9Q3L6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
4930579F01RikE9Q3L6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930579F01RikE9Q3L6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930579F01RikE9Q3L6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930579F01RikE9Q3L6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930579F01RikE9Q3L6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930579F01RikE9Q3L6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930579F01RikE9Q3L6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930579F01RikE9Q3L6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930579F01RikE9Q3L6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930579F01RikE9Q3L6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930579F01RikE9Q3L6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930579F01RikE9Q3L6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930579F01RikE9Q3L6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930579F01RikE9Q3L6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930579F01RikE9Q3L6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930579F01RikE9Q3L6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930579F01RikE9Q3L6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930579F01RikE9Q3L6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930579F01RikE9Q3L6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930579F01RikE9Q3L6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930579F01RikE9Q3L6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930579F01RikE9Q3L6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930579F01RikE9Q3L6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930579F01RikE9Q3L6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930579F01RikE9Q3L6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930579F01RikE9Q3L6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
4930579F01RikE9Q3L6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
4930579F01RikE9Q3L6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4930579F01RikE9Q3L6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4930579F01RikE9Q3L6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4930579F01RikE9Q3L6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
4930579F01RikE9Q3L6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930579F01RikE9Q3L6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930579F01RikE9Q3L6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930579F01RikE9Q3L6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930579F01RikE9Q3L6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms