Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
2610021A01RikE9Q0Q3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
2610021A01RikE9Q0Q3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
2610021A01RikE9Q0Q3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
2610021A01RikE9Q0Q3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
2610021A01RikE9Q0Q3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
2610021A01RikE9Q0Q3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
2610021A01RikE9Q0Q3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
2610021A01RikE9Q0Q3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
2610021A01RikE9Q0Q3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
2610021A01RikE9Q0Q3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
2610021A01RikE9Q0Q3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
2610021A01RikE9Q0Q3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
2610021A01RikE9Q0Q3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
2610021A01RikE9Q0Q3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
2610021A01RikE9Q0Q3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
2610021A01RikE9Q0Q3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
2610021A01RikE9Q0Q3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
2610021A01RikE9Q0Q3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
2610021A01RikE9Q0Q3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
2610021A01RikE9Q0Q3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
2610021A01RikE9Q0Q3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
2610021A01RikE9Q0Q3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
2610021A01RikE9Q0Q3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
2610021A01RikE9Q0Q3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
2610021A01RikE9Q0Q3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
2610021A01RikE9Q0Q3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
2610021A01RikE9Q0Q3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
2610021A01RikE9Q0Q3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
2610021A01RikE9Q0Q3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
2610021A01RikE9Q0Q3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
2610021A01RikE9Q0Q3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
2610021A01RikE9Q0Q3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
2610021A01RikE9Q0Q3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
2610021A01RikE9Q0Q3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
2610021A01RikE9Q0Q3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
2610021A01RikE9Q0Q3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
2610021A01RikE9Q0Q3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
2610021A01RikE9Q0Q3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
2610021A01RikE9Q0Q3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
2610021A01RikE9Q0Q3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
2610021A01RikE9Q0Q3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
2610021A01RikE9Q0Q3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
2610021A01RikE9Q0Q3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
2610021A01RikE9Q0Q3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
2610021A01RikE9Q0Q3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
2610021A01RikE9Q0Q3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
2610021A01RikE9Q0Q3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
2610021A01RikE9Q0Q3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
2610021A01RikE9Q0Q3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
2610021A01RikE9Q0Q3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
2610021A01RikE9Q0Q3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
2610021A01RikE9Q0Q3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
2610021A01RikE9Q0Q3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
2610021A01RikE9Q0Q3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
2610021A01RikE9Q0Q3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
2610021A01RikE9Q0Q3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
2610021A01RikE9Q0Q3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
2610021A01RikE9Q0Q3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
2610021A01RikE9Q0Q3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
2610021A01RikE9Q0Q3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
2610021A01RikE9Q0Q3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
2610021A01RikE9Q0Q3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
2610021A01RikE9Q0Q3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
2610021A01RikE9Q0Q3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
2610021A01RikE9Q0Q3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
2610021A01RikE9Q0Q3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
2610021A01RikE9Q0Q3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
2610021A01RikE9Q0Q3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
2610021A01RikE9Q0Q3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
2610021A01RikE9Q0Q3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
2610021A01RikE9Q0Q3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
2610021A01RikE9Q0Q3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
2610021A01RikE9Q0Q3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
2610021A01RikE9Q0Q3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
2610021A01RikE9Q0Q3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
2610021A01RikE9Q0Q3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
2610021A01RikE9Q0Q3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
2610021A01RikE9Q0Q3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
2610021A01RikE9Q0Q3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
2610021A01RikE9Q0Q3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
2610021A01RikE9Q0Q3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
2610021A01RikE9Q0Q3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
2610021A01RikE9Q0Q3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
2610021A01RikE9Q0Q3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
2610021A01RikE9Q0Q3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
2610021A01RikE9Q0Q3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
2610021A01RikE9Q0Q3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
2610021A01RikE9Q0Q3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
2610021A01RikE9Q0Q3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
2610021A01RikE9Q0Q3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
2610021A01RikE9Q0Q3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms