Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Klhl3E0CZ16 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Klhl3E0CZ16 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Klhl3E0CZ16 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Klhl3E0CZ16 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Klhl3E0CZ16 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Klhl3E0CZ16 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Klhl3E0CZ16 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Klhl3E0CZ16 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Klhl3E0CZ16 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Klhl3E0CZ16 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klhl3E0CZ16 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klhl3E0CZ16 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klhl3E0CZ16 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klhl3E0CZ16 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Klhl3E0CZ16 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Klhl3E0CZ16 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klhl3E0CZ16 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Klhl3E0CZ16 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Klhl3E0CZ16 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Klhl3E0CZ16 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Klhl3E0CZ16 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Klhl3E0CZ16 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Klhl3E0CZ16 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Klhl3E0CZ16 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Klhl3E0CZ16 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Klhl3E0CZ16 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Klhl3E0CZ16 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Klhl3E0CZ16 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klhl3E0CZ16 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klhl3E0CZ16 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klhl3E0CZ16 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klhl3E0CZ16 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klhl3E0CZ16 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klhl3E0CZ16 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klhl3E0CZ16 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klhl3E0CZ16 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klhl3E0CZ16 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klhl3E0CZ16 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klhl3E0CZ16 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klhl3E0CZ16 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klhl3E0CZ16 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Klhl3E0CZ16 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Klhl3E0CZ16 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Klhl3E0CZ16 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Klhl3E0CZ16 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klhl3E0CZ16 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klhl3E0CZ16 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klhl3E0CZ16 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klhl3E0CZ16 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klhl3E0CZ16 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Klhl3E0CZ16 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Klhl3E0CZ16 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Klhl3E0CZ16 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Klhl3E0CZ16 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Klhl3E0CZ16 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Klhl3E0CZ16 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Klhl3E0CZ16 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Klhl3E0CZ16 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Klhl3E0CZ16 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Klhl3E0CZ16 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Klhl3E0CZ16 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Klhl3E0CZ16 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Klhl3E0CZ16 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Klhl3E0CZ16 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Klhl3E0CZ16 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Klhl3E0CZ16 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Klhl3E0CZ16 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Klhl3E0CZ16 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Klhl3E0CZ16 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Klhl3E0CZ16 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Klhl3E0CZ16 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Klhl3E0CZ16 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Klhl3E0CZ16 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Klhl3E0CZ16 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Klhl3E0CZ16 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Klhl3E0CZ16 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Klhl3E0CZ16 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Klhl3E0CZ16 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Klhl3E0CZ16 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Klhl3E0CZ16 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Klhl3E0CZ16 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Klhl3E0CZ16 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Klhl3E0CZ16 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Klhl3E0CZ16 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Klhl3E0CZ16 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Klhl3E0CZ16 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Klhl3E0CZ16 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Klhl3E0CZ16 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Klhl3E0CZ16 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Klhl3E0CZ16 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Klhl3E0CZ16 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Klhl3E0CZ16 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Klhl3E0CZ16 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Klhl3E0CZ16 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Klhl3E0CZ16 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Klhl3E0CZ16 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Klhl3E0CZ16 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Klhl3E0CZ16 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Klhl3E0CZ16 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms