Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccnb1ip1D3Z3K2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccnb1ip1D3Z3K2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccnb1ip1D3Z3K2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccnb1ip1D3Z3K2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccnb1ip1D3Z3K2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccnb1ip1D3Z3K2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccnb1ip1D3Z3K2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccnb1ip1D3Z3K2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccnb1ip1D3Z3K2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccnb1ip1D3Z3K2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccnb1ip1D3Z3K2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccnb1ip1D3Z3K2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccnb1ip1D3Z3K2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccnb1ip1D3Z3K2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccnb1ip1D3Z3K2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccnb1ip1D3Z3K2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccnb1ip1D3Z3K2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccnb1ip1D3Z3K2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccnb1ip1D3Z3K2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccnb1ip1D3Z3K2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccnb1ip1D3Z3K2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccnb1ip1D3Z3K2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccnb1ip1D3Z3K2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccnb1ip1D3Z3K2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccnb1ip1D3Z3K2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccnb1ip1D3Z3K2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccnb1ip1D3Z3K2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccnb1ip1D3Z3K2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccnb1ip1D3Z3K2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccnb1ip1D3Z3K2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccnb1ip1D3Z3K2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccnb1ip1D3Z3K2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccnb1ip1D3Z3K2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccnb1ip1D3Z3K2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccnb1ip1D3Z3K2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms