Protein–RNA interactions for Protein: D3YY23

Lonrf1, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 762 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf1D3YY23 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lonrf1D3YY23 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lonrf1D3YY23 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lonrf1D3YY23 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Lonrf1D3YY23 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lonrf1D3YY23 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lonrf1D3YY23 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lonrf1D3YY23 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lonrf1D3YY23 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lonrf1D3YY23 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lonrf1D3YY23 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lonrf1D3YY23 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lonrf1D3YY23 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lonrf1D3YY23 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lonrf1D3YY23 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lonrf1D3YY23 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lonrf1D3YY23 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lonrf1D3YY23 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Lonrf1D3YY23 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lonrf1D3YY23 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lonrf1D3YY23 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lonrf1D3YY23 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Lonrf1D3YY23 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lonrf1D3YY23 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lonrf1D3YY23 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lonrf1D3YY23 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lonrf1D3YY23 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lonrf1D3YY23 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Lonrf1D3YY23 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lonrf1D3YY23 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lonrf1D3YY23 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lonrf1D3YY23 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lonrf1D3YY23 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lonrf1D3YY23 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lonrf1D3YY23 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lonrf1D3YY23 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lonrf1D3YY23 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lonrf1D3YY23 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lonrf1D3YY23 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lonrf1D3YY23 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lonrf1D3YY23 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lonrf1D3YY23 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lonrf1D3YY23 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lonrf1D3YY23 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lonrf1D3YY23 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lonrf1D3YY23 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lonrf1D3YY23 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lonrf1D3YY23 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lonrf1D3YY23 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lonrf1D3YY23 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lonrf1D3YY23 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lonrf1D3YY23 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Lonrf1D3YY23 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lonrf1D3YY23 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lonrf1D3YY23 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lonrf1D3YY23 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lonrf1D3YY23 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lonrf1D3YY23 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lonrf1D3YY23 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lonrf1D3YY23 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lonrf1D3YY23 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lonrf1D3YY23 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lonrf1D3YY23 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lonrf1D3YY23 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lonrf1D3YY23 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lonrf1D3YY23 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lonrf1D3YY23 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lonrf1D3YY23 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lonrf1D3YY23 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Lonrf1D3YY23 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lonrf1D3YY23 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lonrf1D3YY23 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lonrf1D3YY23 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lonrf1D3YY23 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lonrf1D3YY23 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lonrf1D3YY23 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lonrf1D3YY23 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lonrf1D3YY23 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lonrf1D3YY23 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lonrf1D3YY23 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lonrf1D3YY23 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lonrf1D3YY23 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lonrf1D3YY23 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lonrf1D3YY23 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lonrf1D3YY23 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lonrf1D3YY23 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Lonrf1D3YY23 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lonrf1D3YY23 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lonrf1D3YY23 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lonrf1D3YY23 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lonrf1D3YY23 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lonrf1D3YY23 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lonrf1D3YY23 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lonrf1D3YY23 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lonrf1D3YY23 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lonrf1D3YY23 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lonrf1D3YY23 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lonrf1D3YY23 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lonrf1D3YY23 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lonrf1D3YY23 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms