Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK8

1700015F17Rik, RIKEN cDNA 1700015F17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700015F17RikD3YUK8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700015F17RikD3YUK8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700015F17RikD3YUK8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700015F17RikD3YUK8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700015F17RikD3YUK8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700015F17RikD3YUK8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700015F17RikD3YUK8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700015F17RikD3YUK8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
1700015F17RikD3YUK8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700015F17RikD3YUK8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700015F17RikD3YUK8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700015F17RikD3YUK8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700015F17RikD3YUK8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700015F17RikD3YUK8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700015F17RikD3YUK8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700015F17RikD3YUK8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700015F17RikD3YUK8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700015F17RikD3YUK8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700015F17RikD3YUK8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700015F17RikD3YUK8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700015F17RikD3YUK8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
1700015F17RikD3YUK8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700015F17RikD3YUK8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700015F17RikD3YUK8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700015F17RikD3YUK8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700015F17RikD3YUK8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700015F17RikD3YUK8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700015F17RikD3YUK8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700015F17RikD3YUK8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700015F17RikD3YUK8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700015F17RikD3YUK8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700015F17RikD3YUK8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700015F17RikD3YUK8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700015F17RikD3YUK8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700015F17RikD3YUK8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700015F17RikD3YUK8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700015F17RikD3YUK8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700015F17RikD3YUK8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700015F17RikD3YUK8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700015F17RikD3YUK8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
1700015F17RikD3YUK8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
1700015F17RikD3YUK8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700015F17RikD3YUK8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700015F17RikD3YUK8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700015F17RikD3YUK8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700015F17RikD3YUK8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700015F17RikD3YUK8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700015F17RikD3YUK8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700015F17RikD3YUK8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700015F17RikD3YUK8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700015F17RikD3YUK8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700015F17RikD3YUK8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700015F17RikD3YUK8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700015F17RikD3YUK8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700015F17RikD3YUK8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700015F17RikD3YUK8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700015F17RikD3YUK8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700015F17RikD3YUK8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700015F17RikD3YUK8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700015F17RikD3YUK8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700015F17RikD3YUK8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700015F17RikD3YUK8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700015F17RikD3YUK8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700015F17RikD3YUK8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700015F17RikD3YUK8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700015F17RikD3YUK8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700015F17RikD3YUK8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700015F17RikD3YUK8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700015F17RikD3YUK8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700015F17RikD3YUK8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700015F17RikD3YUK8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
1700015F17RikD3YUK8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700015F17RikD3YUK8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700015F17RikD3YUK8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700015F17RikD3YUK8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700015F17RikD3YUK8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700015F17RikD3YUK8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700015F17RikD3YUK8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700015F17RikD3YUK8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700015F17RikD3YUK8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
1700015F17RikD3YUK8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700015F17RikD3YUK8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700015F17RikD3YUK8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700015F17RikD3YUK8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700015F17RikD3YUK8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700015F17RikD3YUK8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
1700015F17RikD3YUK8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700015F17RikD3YUK8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700015F17RikD3YUK8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
1700015F17RikD3YUK8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700015F17RikD3YUK8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700015F17RikD3YUK8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700015F17RikD3YUK8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700015F17RikD3YUK8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700015F17RikD3YUK8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700015F17RikD3YUK8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700015F17RikD3YUK8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700015F17RikD3YUK8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700015F17RikD3YUK8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700015F17RikD3YUK8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.6 ms