Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clip3B9EHT4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clip3B9EHT4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clip3B9EHT4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clip3B9EHT4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clip3B9EHT4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clip3B9EHT4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clip3B9EHT4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clip3B9EHT4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clip3B9EHT4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clip3B9EHT4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clip3B9EHT4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Clip3B9EHT4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Clip3B9EHT4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clip3B9EHT4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clip3B9EHT4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clip3B9EHT4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clip3B9EHT4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clip3B9EHT4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clip3B9EHT4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Clip3B9EHT4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clip3B9EHT4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clip3B9EHT4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clip3B9EHT4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clip3B9EHT4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clip3B9EHT4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clip3B9EHT4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clip3B9EHT4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clip3B9EHT4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clip3B9EHT4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clip3B9EHT4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Clip3B9EHT4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clip3B9EHT4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clip3B9EHT4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clip3B9EHT4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Clip3B9EHT4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clip3B9EHT4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clip3B9EHT4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clip3B9EHT4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clip3B9EHT4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clip3B9EHT4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Clip3B9EHT4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clip3B9EHT4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clip3B9EHT4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clip3B9EHT4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Clip3B9EHT4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Clip3B9EHT4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Clip3B9EHT4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clip3B9EHT4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clip3B9EHT4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clip3B9EHT4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clip3B9EHT4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clip3B9EHT4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clip3B9EHT4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clip3B9EHT4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clip3B9EHT4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clip3B9EHT4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clip3B9EHT4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clip3B9EHT4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clip3B9EHT4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clip3B9EHT4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clip3B9EHT4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clip3B9EHT4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Clip3B9EHT4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clip3B9EHT4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clip3B9EHT4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clip3B9EHT4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Clip3B9EHT4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clip3B9EHT4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clip3B9EHT4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Clip3B9EHT4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clip3B9EHT4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Clip3B9EHT4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Clip3B9EHT4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Clip3B9EHT4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Clip3B9EHT4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Clip3B9EHT4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Clip3B9EHT4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clip3B9EHT4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clip3B9EHT4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clip3B9EHT4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clip3B9EHT4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clip3B9EHT4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Clip3B9EHT4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clip3B9EHT4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clip3B9EHT4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clip3B9EHT4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clip3B9EHT4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clip3B9EHT4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clip3B9EHT4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clip3B9EHT4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clip3B9EHT4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clip3B9EHT4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clip3B9EHT4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clip3B9EHT4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clip3B9EHT4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clip3B9EHT4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clip3B9EHT4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clip3B9EHT4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Clip3B9EHT4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms