Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rrn3B2RS91 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rrn3B2RS91 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrn3B2RS91 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrn3B2RS91 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrn3B2RS91 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrn3B2RS91 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrn3B2RS91 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrn3B2RS91 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrn3B2RS91 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrn3B2RS91 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rrn3B2RS91 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rrn3B2RS91 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rrn3B2RS91 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rrn3B2RS91 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rrn3B2RS91 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Rrn3B2RS91 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Rrn3B2RS91 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rrn3B2RS91 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rrn3B2RS91 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rrn3B2RS91 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rrn3B2RS91 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rrn3B2RS91 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rrn3B2RS91 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rrn3B2RS91 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rrn3B2RS91 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rrn3B2RS91 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rrn3B2RS91 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rrn3B2RS91 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rrn3B2RS91 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rrn3B2RS91 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rrn3B2RS91 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rrn3B2RS91 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rrn3B2RS91 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rrn3B2RS91 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rrn3B2RS91 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Rrn3B2RS91 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rrn3B2RS91 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rrn3B2RS91 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rrn3B2RS91 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rrn3B2RS91 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rrn3B2RS91 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rrn3B2RS91 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rrn3B2RS91 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rrn3B2RS91 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rrn3B2RS91 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rrn3B2RS91 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rrn3B2RS91 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rrn3B2RS91 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rrn3B2RS91 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rrn3B2RS91 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Rrn3B2RS91 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Rrn3B2RS91 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Rrn3B2RS91 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rrn3B2RS91 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Rrn3B2RS91 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rrn3B2RS91 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rrn3B2RS91 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rrn3B2RS91 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rrn3B2RS91 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rrn3B2RS91 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rrn3B2RS91 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rrn3B2RS91 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rrn3B2RS91 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rrn3B2RS91 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rrn3B2RS91 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rrn3B2RS91 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rrn3B2RS91 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rrn3B2RS91 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rrn3B2RS91 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rrn3B2RS91 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rrn3B2RS91 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rrn3B2RS91 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rrn3B2RS91 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rrn3B2RS91 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rrn3B2RS91 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rrn3B2RS91 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rrn3B2RS91 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rrn3B2RS91 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rrn3B2RS91 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rrn3B2RS91 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rrn3B2RS91 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rrn3B2RS91 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rrn3B2RS91 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rrn3B2RS91 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rrn3B2RS91 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rrn3B2RS91 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rrn3B2RS91 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rrn3B2RS91 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rrn3B2RS91 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rrn3B2RS91 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rrn3B2RS91 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rrn3B2RS91 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rrn3B2RS91 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rrn3B2RS91 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rrn3B2RS91 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rrn3B2RS91 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rrn3B2RS91 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rrn3B2RS91 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rrn3B2RS91 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
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