Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zbed5B2RPU8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zbed5B2RPU8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zbed5B2RPU8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zbed5B2RPU8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zbed5B2RPU8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zbed5B2RPU8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zbed5B2RPU8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zbed5B2RPU8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zbed5B2RPU8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zbed5B2RPU8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Zbed5B2RPU8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zbed5B2RPU8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zbed5B2RPU8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zbed5B2RPU8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zbed5B2RPU8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zbed5B2RPU8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zbed5B2RPU8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zbed5B2RPU8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Zbed5B2RPU8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Zbed5B2RPU8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zbed5B2RPU8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zbed5B2RPU8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zbed5B2RPU8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zbed5B2RPU8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zbed5B2RPU8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zbed5B2RPU8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zbed5B2RPU8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Zbed5B2RPU8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zbed5B2RPU8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zbed5B2RPU8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zbed5B2RPU8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zbed5B2RPU8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zbed5B2RPU8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zbed5B2RPU8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zbed5B2RPU8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zbed5B2RPU8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zbed5B2RPU8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zbed5B2RPU8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zbed5B2RPU8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zbed5B2RPU8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zbed5B2RPU8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zbed5B2RPU8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Zbed5B2RPU8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zbed5B2RPU8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zbed5B2RPU8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zbed5B2RPU8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zbed5B2RPU8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zbed5B2RPU8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zbed5B2RPU8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zbed5B2RPU8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zbed5B2RPU8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zbed5B2RPU8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zbed5B2RPU8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zbed5B2RPU8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Zbed5B2RPU8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Zbed5B2RPU8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zbed5B2RPU8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Zbed5B2RPU8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zbed5B2RPU8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zbed5B2RPU8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zbed5B2RPU8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zbed5B2RPU8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zbed5B2RPU8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zbed5B2RPU8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zbed5B2RPU8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zbed5B2RPU8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zbed5B2RPU8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Zbed5B2RPU8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zbed5B2RPU8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zbed5B2RPU8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zbed5B2RPU8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zbed5B2RPU8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zbed5B2RPU8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zbed5B2RPU8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zbed5B2RPU8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Zbed5B2RPU8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zbed5B2RPU8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zbed5B2RPU8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zbed5B2RPU8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zbed5B2RPU8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zbed5B2RPU8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zbed5B2RPU8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zbed5B2RPU8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Zbed5B2RPU8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zbed5B2RPU8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zbed5B2RPU8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zbed5B2RPU8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zbed5B2RPU8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zbed5B2RPU8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zbed5B2RPU8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zbed5B2RPU8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zbed5B2RPU8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zbed5B2RPU8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zbed5B2RPU8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zbed5B2RPU8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Zbed5B2RPU8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zbed5B2RPU8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Zbed5B2RPU8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zbed5B2RPU8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms