Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Brpf3B2KF05 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Brpf3B2KF05 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Brpf3B2KF05 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Brpf3B2KF05 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Brpf3B2KF05 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Brpf3B2KF05 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Brpf3B2KF05 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Brpf3B2KF05 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Brpf3B2KF05 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Brpf3B2KF05 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Brpf3B2KF05 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Brpf3B2KF05 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Brpf3B2KF05 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Brpf3B2KF05 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Brpf3B2KF05 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Brpf3B2KF05 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Brpf3B2KF05 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Brpf3B2KF05 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Brpf3B2KF05 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Brpf3B2KF05 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Brpf3B2KF05 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Brpf3B2KF05 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Brpf3B2KF05 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Brpf3B2KF05 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Brpf3B2KF05 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Brpf3B2KF05 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Brpf3B2KF05 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Brpf3B2KF05 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Brpf3B2KF05 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Brpf3B2KF05 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Brpf3B2KF05 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Brpf3B2KF05 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Brpf3B2KF05 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Brpf3B2KF05 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Brpf3B2KF05 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Brpf3B2KF05 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Brpf3B2KF05 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Brpf3B2KF05 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Brpf3B2KF05 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Brpf3B2KF05 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Brpf3B2KF05 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Brpf3B2KF05 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Brpf3B2KF05 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Brpf3B2KF05 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Brpf3B2KF05 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Brpf3B2KF05 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Brpf3B2KF05 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Brpf3B2KF05 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Brpf3B2KF05 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Brpf3B2KF05 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Brpf3B2KF05 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Brpf3B2KF05 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Brpf3B2KF05 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Brpf3B2KF05 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Brpf3B2KF05 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Brpf3B2KF05 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Brpf3B2KF05 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Brpf3B2KF05 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Brpf3B2KF05 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Brpf3B2KF05 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Brpf3B2KF05 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Brpf3B2KF05 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Brpf3B2KF05 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Brpf3B2KF05 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Brpf3B2KF05 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Brpf3B2KF05 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Brpf3B2KF05 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Brpf3B2KF05 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Brpf3B2KF05 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Brpf3B2KF05 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Brpf3B2KF05 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Brpf3B2KF05 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Brpf3B2KF05 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Brpf3B2KF05 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Brpf3B2KF05 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Brpf3B2KF05 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Brpf3B2KF05 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Brpf3B2KF05 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Brpf3B2KF05 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Brpf3B2KF05 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Brpf3B2KF05 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Brpf3B2KF05 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Brpf3B2KF05 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Brpf3B2KF05 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Brpf3B2KF05 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Brpf3B2KF05 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Brpf3B2KF05 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Brpf3B2KF05 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Brpf3B2KF05 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Brpf3B2KF05 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Brpf3B2KF05 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Brpf3B2KF05 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Brpf3B2KF05 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Brpf3B2KF05 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Brpf3B2KF05 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Brpf3B2KF05 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Brpf3B2KF05 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Brpf3B2KF05 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Brpf3B2KF05 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms