Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CtcflA2APF3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CtcflA2APF3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CtcflA2APF3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CtcflA2APF3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CtcflA2APF3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CtcflA2APF3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CtcflA2APF3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CtcflA2APF3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CtcflA2APF3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CtcflA2APF3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CtcflA2APF3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CtcflA2APF3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CtcflA2APF3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CtcflA2APF3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CtcflA2APF3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CtcflA2APF3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CtcflA2APF3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CtcflA2APF3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CtcflA2APF3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CtcflA2APF3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CtcflA2APF3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CtcflA2APF3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CtcflA2APF3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CtcflA2APF3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CtcflA2APF3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CtcflA2APF3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CtcflA2APF3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CtcflA2APF3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CtcflA2APF3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CtcflA2APF3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CtcflA2APF3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CtcflA2APF3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CtcflA2APF3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CtcflA2APF3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CtcflA2APF3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CtcflA2APF3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CtcflA2APF3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CtcflA2APF3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CtcflA2APF3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CtcflA2APF3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CtcflA2APF3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CtcflA2APF3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CtcflA2APF3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CtcflA2APF3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CtcflA2APF3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CtcflA2APF3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CtcflA2APF3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CtcflA2APF3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CtcflA2APF3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CtcflA2APF3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CtcflA2APF3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CtcflA2APF3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CtcflA2APF3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CtcflA2APF3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CtcflA2APF3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CtcflA2APF3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CtcflA2APF3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CtcflA2APF3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CtcflA2APF3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CtcflA2APF3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CtcflA2APF3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CtcflA2APF3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CtcflA2APF3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CtcflA2APF3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CtcflA2APF3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CtcflA2APF3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CtcflA2APF3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CtcflA2APF3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CtcflA2APF3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CtcflA2APF3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CtcflA2APF3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CtcflA2APF3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CtcflA2APF3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CtcflA2APF3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CtcflA2APF3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CtcflA2APF3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CtcflA2APF3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CtcflA2APF3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CtcflA2APF3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CtcflA2APF3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CtcflA2APF3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CtcflA2APF3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CtcflA2APF3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CtcflA2APF3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CtcflA2APF3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CtcflA2APF3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CtcflA2APF3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CtcflA2APF3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CtcflA2APF3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CtcflA2APF3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CtcflA2APF3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CtcflA2APF3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CtcflA2APF3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CtcflA2APF3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CtcflA2APF3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CtcflA2APF3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CtcflA2APF3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CtcflA2APF3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CtcflA2APF3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
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