Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ttll9A2APC3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ttll9A2APC3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ttll9A2APC3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ttll9A2APC3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ttll9A2APC3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ttll9A2APC3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ttll9A2APC3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttll9A2APC3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttll9A2APC3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttll9A2APC3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttll9A2APC3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttll9A2APC3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttll9A2APC3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttll9A2APC3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttll9A2APC3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ttll9A2APC3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ttll9A2APC3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ttll9A2APC3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ttll9A2APC3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ttll9A2APC3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ttll9A2APC3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ttll9A2APC3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ttll9A2APC3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ttll9A2APC3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ttll9A2APC3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ttll9A2APC3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ttll9A2APC3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ttll9A2APC3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ttll9A2APC3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ttll9A2APC3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ttll9A2APC3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ttll9A2APC3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ttll9A2APC3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttll9A2APC3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ttll9A2APC3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ttll9A2APC3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ttll9A2APC3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttll9A2APC3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttll9A2APC3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttll9A2APC3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttll9A2APC3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttll9A2APC3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttll9A2APC3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttll9A2APC3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttll9A2APC3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttll9A2APC3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttll9A2APC3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttll9A2APC3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttll9A2APC3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttll9A2APC3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttll9A2APC3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttll9A2APC3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttll9A2APC3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttll9A2APC3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttll9A2APC3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttll9A2APC3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttll9A2APC3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttll9A2APC3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttll9A2APC3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttll9A2APC3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttll9A2APC3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttll9A2APC3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttll9A2APC3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttll9A2APC3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttll9A2APC3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttll9A2APC3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttll9A2APC3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttll9A2APC3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttll9A2APC3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttll9A2APC3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttll9A2APC3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttll9A2APC3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttll9A2APC3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttll9A2APC3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttll9A2APC3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttll9A2APC3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttll9A2APC3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ttll9A2APC3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ttll9A2APC3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ttll9A2APC3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttll9A2APC3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttll9A2APC3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttll9A2APC3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttll9A2APC3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttll9A2APC3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ttll9A2APC3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ttll9A2APC3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ttll9A2APC3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ttll9A2APC3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttll9A2APC3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttll9A2APC3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ttll9A2APC3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ttll9A2APC3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ttll9A2APC3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ttll9A2APC3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ttll9A2APC3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ttll9A2APC3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ttll9A2APC3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ttll9A2APC3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms