Protein–RNA interactions for Protein: A2AMT6

Vmn1r2, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r2A2AMT6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn1r2A2AMT6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn1r2A2AMT6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn1r2A2AMT6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn1r2A2AMT6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn1r2A2AMT6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn1r2A2AMT6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn1r2A2AMT6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn1r2A2AMT6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn1r2A2AMT6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn1r2A2AMT6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn1r2A2AMT6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn1r2A2AMT6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn1r2A2AMT6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn1r2A2AMT6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn1r2A2AMT6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn1r2A2AMT6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn1r2A2AMT6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn1r2A2AMT6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn1r2A2AMT6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn1r2A2AMT6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn1r2A2AMT6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn1r2A2AMT6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn1r2A2AMT6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn1r2A2AMT6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn1r2A2AMT6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vmn1r2A2AMT6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vmn1r2A2AMT6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vmn1r2A2AMT6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vmn1r2A2AMT6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vmn1r2A2AMT6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn1r2A2AMT6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vmn1r2A2AMT6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Vmn1r2A2AMT6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vmn1r2A2AMT6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vmn1r2A2AMT6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Vmn1r2A2AMT6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vmn1r2A2AMT6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Vmn1r2A2AMT6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vmn1r2A2AMT6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Vmn1r2A2AMT6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vmn1r2A2AMT6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vmn1r2A2AMT6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vmn1r2A2AMT6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Vmn1r2A2AMT6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn1r2A2AMT6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn1r2A2AMT6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn1r2A2AMT6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vmn1r2A2AMT6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vmn1r2A2AMT6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vmn1r2A2AMT6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vmn1r2A2AMT6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vmn1r2A2AMT6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn1r2A2AMT6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn1r2A2AMT6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn1r2A2AMT6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn1r2A2AMT6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn1r2A2AMT6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn1r2A2AMT6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn1r2A2AMT6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
Vmn1r2A2AMT6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn1r2A2AMT6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn1r2A2AMT6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn1r2A2AMT6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn1r2A2AMT6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn1r2A2AMT6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn1r2A2AMT6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r2A2AMT6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r2A2AMT6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r2A2AMT6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r2A2AMT6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r2A2AMT6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r2A2AMT6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vmn1r2A2AMT6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vmn1r2A2AMT6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vmn1r2A2AMT6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vmn1r2A2AMT6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vmn1r2A2AMT6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vmn1r2A2AMT6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vmn1r2A2AMT6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vmn1r2A2AMT6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r2A2AMT6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r2A2AMT6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r2A2AMT6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r2A2AMT6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r2A2AMT6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r2A2AMT6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r2A2AMT6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r2A2AMT6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r2A2AMT6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r2A2AMT6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn1r2A2AMT6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn1r2A2AMT6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn1r2A2AMT6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn1r2A2AMT6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn1r2A2AMT6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn1r2A2AMT6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Vmn1r2A2AMT6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vmn1r2A2AMT6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vmn1r2A2AMT6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms