Protein–RNA interactions for Protein: A2A699

Fam171a2, Protein FAM171A2, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171a2A2A699 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam171a2A2A699 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam171a2A2A699 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam171a2A2A699 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam171a2A2A699 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam171a2A2A699 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam171a2A2A699 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam171a2A2A699 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam171a2A2A699 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam171a2A2A699 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam171a2A2A699 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam171a2A2A699 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam171a2A2A699 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam171a2A2A699 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Fam171a2A2A699 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam171a2A2A699 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam171a2A2A699 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam171a2A2A699 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam171a2A2A699 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam171a2A2A699 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam171a2A2A699 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fam171a2A2A699 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fam171a2A2A699 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam171a2A2A699 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam171a2A2A699 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam171a2A2A699 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam171a2A2A699 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam171a2A2A699 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam171a2A2A699 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam171a2A2A699 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam171a2A2A699 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam171a2A2A699 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam171a2A2A699 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam171a2A2A699 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam171a2A2A699 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam171a2A2A699 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam171a2A2A699 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam171a2A2A699 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam171a2A2A699 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam171a2A2A699 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam171a2A2A699 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam171a2A2A699 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam171a2A2A699 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam171a2A2A699 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam171a2A2A699 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam171a2A2A699 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam171a2A2A699 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam171a2A2A699 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam171a2A2A699 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam171a2A2A699 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam171a2A2A699 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam171a2A2A699 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam171a2A2A699 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam171a2A2A699 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam171a2A2A699 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam171a2A2A699 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam171a2A2A699 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam171a2A2A699 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam171a2A2A699 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam171a2A2A699 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam171a2A2A699 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam171a2A2A699 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam171a2A2A699 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam171a2A2A699 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam171a2A2A699 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam171a2A2A699 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam171a2A2A699 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam171a2A2A699 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam171a2A2A699 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam171a2A2A699 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam171a2A2A699 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam171a2A2A699 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam171a2A2A699 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam171a2A2A699 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Fam171a2A2A699 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Fam171a2A2A699 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Fam171a2A2A699 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Fam171a2A2A699 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam171a2A2A699 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam171a2A2A699 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam171a2A2A699 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam171a2A2A699 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam171a2A2A699 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam171a2A2A699 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam171a2A2A699 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam171a2A2A699 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam171a2A2A699 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam171a2A2A699 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam171a2A2A699 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam171a2A2A699 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam171a2A2A699 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam171a2A2A699 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam171a2A2A699 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam171a2A2A699 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Fam171a2A2A699 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam171a2A2A699 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam171a2A2A699 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam171a2A2A699 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam171a2A2A699 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam171a2A2A699 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms