Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YCZ6

1700016G14Rik, RIKEN cDNA 1700016G14 gene, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700016G14RikA0A286YCZ6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
1700016G14RikA0A286YCZ6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
1700016G14RikA0A286YCZ6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
1700016G14RikA0A286YCZ6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
1700016G14RikA0A286YCZ6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
1700016G14RikA0A286YCZ6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
1700016G14RikA0A286YCZ6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
1700016G14RikA0A286YCZ6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
1700016G14RikA0A286YCZ6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
1700016G14RikA0A286YCZ6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
1700016G14RikA0A286YCZ6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
1700016G14RikA0A286YCZ6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
1700016G14RikA0A286YCZ6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
1700016G14RikA0A286YCZ6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
1700016G14RikA0A286YCZ6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
1700016G14RikA0A286YCZ6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
1700016G14RikA0A286YCZ6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
1700016G14RikA0A286YCZ6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
1700016G14RikA0A286YCZ6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
1700016G14RikA0A286YCZ6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
1700016G14RikA0A286YCZ6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
1700016G14RikA0A286YCZ6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
1700016G14RikA0A286YCZ6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
1700016G14RikA0A286YCZ6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
1700016G14RikA0A286YCZ6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
1700016G14RikA0A286YCZ6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
1700016G14RikA0A286YCZ6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
1700016G14RikA0A286YCZ6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
1700016G14RikA0A286YCZ6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
1700016G14RikA0A286YCZ6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
1700016G14RikA0A286YCZ6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
1700016G14RikA0A286YCZ6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
1700016G14RikA0A286YCZ6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
1700016G14RikA0A286YCZ6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
1700016G14RikA0A286YCZ6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
1700016G14RikA0A286YCZ6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
1700016G14RikA0A286YCZ6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
1700016G14RikA0A286YCZ6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
1700016G14RikA0A286YCZ6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
1700016G14RikA0A286YCZ6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
1700016G14RikA0A286YCZ6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
1700016G14RikA0A286YCZ6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
1700016G14RikA0A286YCZ6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
1700016G14RikA0A286YCZ6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
1700016G14RikA0A286YCZ6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
1700016G14RikA0A286YCZ6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
1700016G14RikA0A286YCZ6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
1700016G14RikA0A286YCZ6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
1700016G14RikA0A286YCZ6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
1700016G14RikA0A286YCZ6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
1700016G14RikA0A286YCZ6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
1700016G14RikA0A286YCZ6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
1700016G14RikA0A286YCZ6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
1700016G14RikA0A286YCZ6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
1700016G14RikA0A286YCZ6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
1700016G14RikA0A286YCZ6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
1700016G14RikA0A286YCZ6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
1700016G14RikA0A286YCZ6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
1700016G14RikA0A286YCZ6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
1700016G14RikA0A286YCZ6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
1700016G14RikA0A286YCZ6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
1700016G14RikA0A286YCZ6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
1700016G14RikA0A286YCZ6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
1700016G14RikA0A286YCZ6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
1700016G14RikA0A286YCZ6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
1700016G14RikA0A286YCZ6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
1700016G14RikA0A286YCZ6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
1700016G14RikA0A286YCZ6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
1700016G14RikA0A286YCZ6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
1700016G14RikA0A286YCZ6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
1700016G14RikA0A286YCZ6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
1700016G14RikA0A286YCZ6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
1700016G14RikA0A286YCZ6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
1700016G14RikA0A286YCZ6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
1700016G14RikA0A286YCZ6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
1700016G14RikA0A286YCZ6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
1700016G14RikA0A286YCZ6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
1700016G14RikA0A286YCZ6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
1700016G14RikA0A286YCZ6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
1700016G14RikA0A286YCZ6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
1700016G14RikA0A286YCZ6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
1700016G14RikA0A286YCZ6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
1700016G14RikA0A286YCZ6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
1700016G14RikA0A286YCZ6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
1700016G14RikA0A286YCZ6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
1700016G14RikA0A286YCZ6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
1700016G14RikA0A286YCZ6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
1700016G14RikA0A286YCZ6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
1700016G14RikA0A286YCZ6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
1700016G14RikA0A286YCZ6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
1700016G14RikA0A286YCZ6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
1700016G14RikA0A286YCZ6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
1700016G14RikA0A286YCZ6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
1700016G14RikA0A286YCZ6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
1700016G14RikA0A286YCZ6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
1700016G14RikA0A286YCZ6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
1700016G14RikA0A286YCZ6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
1700016G14RikA0A286YCZ6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
1700016G14RikA0A286YCZ6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
1700016G14RikA0A286YCZ6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms