Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1K3

B230359F08Rik, RIKEN cDNA B230359F08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B230359F08RikA0A0B4J1K3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B230359F08RikA0A0B4J1K3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B230359F08RikA0A0B4J1K3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
B230359F08RikA0A0B4J1K3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B230359F08RikA0A0B4J1K3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B230359F08RikA0A0B4J1K3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B230359F08RikA0A0B4J1K3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
B230359F08RikA0A0B4J1K3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
B230359F08RikA0A0B4J1K3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
B230359F08RikA0A0B4J1K3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
B230359F08RikA0A0B4J1K3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms