Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YWQ1

Trbv23, T cell receptor beta, variable V23 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trbv23A0A0A6YWQ1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trbv23A0A0A6YWQ1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trbv23A0A0A6YWQ1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trbv23A0A0A6YWQ1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trbv23A0A0A6YWQ1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trbv23A0A0A6YWQ1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trbv23A0A0A6YWQ1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trbv23A0A0A6YWQ1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trbv23A0A0A6YWQ1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trbv23A0A0A6YWQ1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trbv23A0A0A6YWQ1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trbv23A0A0A6YWQ1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trbv23A0A0A6YWQ1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trbv23A0A0A6YWQ1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trbv23A0A0A6YWQ1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trbv23A0A0A6YWQ1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trbv23A0A0A6YWQ1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trbv23A0A0A6YWQ1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trbv23A0A0A6YWQ1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trbv23A0A0A6YWQ1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trbv23A0A0A6YWQ1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trbv23A0A0A6YWQ1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trbv23A0A0A6YWQ1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trbv23A0A0A6YWQ1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trbv23A0A0A6YWQ1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trbv23A0A0A6YWQ1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trbv23A0A0A6YWQ1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Trbv23A0A0A6YWQ1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Trbv23A0A0A6YWQ1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trbv23A0A0A6YWQ1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trbv23A0A0A6YWQ1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trbv23A0A0A6YWQ1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trbv23A0A0A6YWQ1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trbv23A0A0A6YWQ1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trbv23A0A0A6YWQ1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trbv23A0A0A6YWQ1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trbv23A0A0A6YWQ1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trbv23A0A0A6YWQ1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trbv23A0A0A6YWQ1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trbv23A0A0A6YWQ1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trbv23A0A0A6YWQ1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trbv23A0A0A6YWQ1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trbv23A0A0A6YWQ1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trbv23A0A0A6YWQ1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms