Protein–RNA interactions for Protein: Q8K467

Tmie, Transmembrane inner ear expressed protein, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TmieQ8K467 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TmieQ8K467 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms