Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
NipblQ6KCD5 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms