Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gps1Q99LD4 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.4 ms