Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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NipblQ6KCD5 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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NipblQ6KCD5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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NipblQ6KCD5 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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NipblQ6KCD5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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NipblQ6KCD5 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
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