Protein–RNA interactions for Protein: P41230

Kdm5c, Lysine-specific demethylase 5C, mousemouse

Predictions only

Length 1,554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5cP41230 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm5cP41230 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm5cP41230 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm5cP41230 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm5cP41230 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm5cP41230 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm5cP41230 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm5cP41230 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm5cP41230 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm5cP41230 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm5cP41230 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm5cP41230 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm5cP41230 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm5cP41230 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms