Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER39

Tor1a, Torsin-1A, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tor1aQ9ER39 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Tor1aQ9ER39 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Tor1aQ9ER39 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Tor1aQ9ER39 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Tor1aQ9ER39 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Tor1aQ9ER39 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tor1aQ9ER39 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Tor1aQ9ER39 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tor1aQ9ER39 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tor1aQ9ER39 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tor1aQ9ER39 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tor1aQ9ER39 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tor1aQ9ER39 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tor1aQ9ER39 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tor1aQ9ER39 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tor1aQ9ER39 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tor1aQ9ER39 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tor1aQ9ER39 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tor1aQ9ER39 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tor1aQ9ER39 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tor1aQ9ER39 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tor1aQ9ER39 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tor1aQ9ER39 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tor1aQ9ER39 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tor1aQ9ER39 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tor1aQ9ER39 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tor1aQ9ER39 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tor1aQ9ER39 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tor1aQ9ER39 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tor1aQ9ER39 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tor1aQ9ER39 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tor1aQ9ER39 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tor1aQ9ER39 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tor1aQ9ER39 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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