Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms