Protein–RNA interactions for Protein: F8VPJ6

Rfx7, Regulatory factor X, 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx7F8VPJ6 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rfx7F8VPJ6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rfx7F8VPJ6 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rfx7F8VPJ6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rfx7F8VPJ6 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rfx7F8VPJ6 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rfx7F8VPJ6 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Rfx7F8VPJ6 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rfx7F8VPJ6 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rfx7F8VPJ6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rfx7F8VPJ6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rfx7F8VPJ6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rfx7F8VPJ6 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rfx7F8VPJ6 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rfx7F8VPJ6 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rfx7F8VPJ6 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rfx7F8VPJ6 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rfx7F8VPJ6 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rfx7F8VPJ6 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rfx7F8VPJ6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rfx7F8VPJ6 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rfx7F8VPJ6 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rfx7F8VPJ6 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rfx7F8VPJ6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rfx7F8VPJ6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rfx7F8VPJ6 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rfx7F8VPJ6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rfx7F8VPJ6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rfx7F8VPJ6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rfx7F8VPJ6 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rfx7F8VPJ6 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rfx7F8VPJ6 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rfx7F8VPJ6 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rfx7F8VPJ6 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rfx7F8VPJ6 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rfx7F8VPJ6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rfx7F8VPJ6 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rfx7F8VPJ6 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rfx7F8VPJ6 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rfx7F8VPJ6 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rfx7F8VPJ6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rfx7F8VPJ6 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rfx7F8VPJ6 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rfx7F8VPJ6 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rfx7F8VPJ6 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rfx7F8VPJ6 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rfx7F8VPJ6 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rfx7F8VPJ6 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rfx7F8VPJ6 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rfx7F8VPJ6 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rfx7F8VPJ6 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rfx7F8VPJ6 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rfx7F8VPJ6 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rfx7F8VPJ6 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rfx7F8VPJ6 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rfx7F8VPJ6 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rfx7F8VPJ6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rfx7F8VPJ6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rfx7F8VPJ6 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rfx7F8VPJ6 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rfx7F8VPJ6 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rfx7F8VPJ6 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rfx7F8VPJ6 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rfx7F8VPJ6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rfx7F8VPJ6 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rfx7F8VPJ6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms