Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG1

Edf1, Endothelial differentiation-related factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edf1Q9JMG1 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Edf1Q9JMG1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms