Protein–RNA interactions for Protein: F8VPJ6

Rfx7, Regulatory factor X, 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx7F8VPJ6 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rfx7F8VPJ6 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rfx7F8VPJ6 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rfx7F8VPJ6 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rfx7F8VPJ6 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rfx7F8VPJ6 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rfx7F8VPJ6 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rfx7F8VPJ6 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rfx7F8VPJ6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rfx7F8VPJ6 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rfx7F8VPJ6 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rfx7F8VPJ6 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rfx7F8VPJ6 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Rfx7F8VPJ6 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rfx7F8VPJ6 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms