Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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NipblQ6KCD5 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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