Protein–RNA interactions for Protein: P70325

Tbx4, T-box transcription factor TBX4, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbx4P70325 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tbx4P70325 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms