Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Cnga1P29974 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Cnga1P29974 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Cnga1P29974 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cnga1P29974 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cnga1P29974 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cnga1P29974 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cnga1P29974 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cnga1P29974 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cnga1P29974 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cnga1P29974 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Cnga1P29974 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnga1P29974 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnga1P29974 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnga1P29974 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnga1P29974 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cnga1P29974 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnga1P29974 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnga1P29974 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Cnga1P29974 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms