Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kif3aP28741 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms