Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5C7

Znf728, Zinc finger protein 728, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf728Q6P5C7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Znf728Q6P5C7 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Znf728Q6P5C7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Znf728Q6P5C7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Znf728Q6P5C7 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Znf728Q6P5C7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Znf728Q6P5C7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Znf728Q6P5C7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Znf728Q6P5C7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Znf728Q6P5C7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf728Q6P5C7 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf728Q6P5C7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf728Q6P5C7 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf728Q6P5C7 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf728Q6P5C7 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf728Q6P5C7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf728Q6P5C7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf728Q6P5C7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf728Q6P5C7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf728Q6P5C7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf728Q6P5C7 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf728Q6P5C7 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf728Q6P5C7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf728Q6P5C7 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf728Q6P5C7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf728Q6P5C7 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf728Q6P5C7 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf728Q6P5C7 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf728Q6P5C7 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf728Q6P5C7 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf728Q6P5C7 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf728Q6P5C7 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf728Q6P5C7 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf728Q6P5C7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf728Q6P5C7 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf728Q6P5C7 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf728Q6P5C7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf728Q6P5C7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf728Q6P5C7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf728Q6P5C7 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf728Q6P5C7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf728Q6P5C7 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf728Q6P5C7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf728Q6P5C7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf728Q6P5C7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf728Q6P5C7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf728Q6P5C7 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf728Q6P5C7 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf728Q6P5C7 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf728Q6P5C7 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf728Q6P5C7 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf728Q6P5C7 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf728Q6P5C7 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf728Q6P5C7 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf728Q6P5C7 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf728Q6P5C7 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf728Q6P5C7 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf728Q6P5C7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf728Q6P5C7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf728Q6P5C7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf728Q6P5C7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf728Q6P5C7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf728Q6P5C7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf728Q6P5C7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf728Q6P5C7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf728Q6P5C7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf728Q6P5C7 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf728Q6P5C7 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf728Q6P5C7 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf728Q6P5C7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf728Q6P5C7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf728Q6P5C7 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf728Q6P5C7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf728Q6P5C7 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf728Q6P5C7 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf728Q6P5C7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf728Q6P5C7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf728Q6P5C7 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf728Q6P5C7 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf728Q6P5C7 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf728Q6P5C7 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf728Q6P5C7 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf728Q6P5C7 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf728Q6P5C7 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf728Q6P5C7 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms