Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnga1P29974 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms