Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5C7

Znf728, Zinc finger protein 728, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf728Q6P5C7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms