Protein–RNA interactions for Protein: P41230

Kdm5c, Lysine-specific demethylase 5C, mousemouse

Predictions only

Length 1,554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5cP41230 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm5cP41230 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm5cP41230 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms