Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RhoP15409 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RhoP15409 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RhoP15409 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RhoP15409 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RhoP15409 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RhoP15409 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RhoP15409 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RhoP15409 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RhoP15409 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RhoP15409 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RhoP15409 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RhoP15409 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RhoP15409 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RhoP15409 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RhoP15409 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RhoP15409 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RhoP15409 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RhoP15409 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RhoP15409 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RhoP15409 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RhoP15409 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RhoP15409 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RhoP15409 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RhoP15409 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RhoP15409 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RhoP15409 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RhoP15409 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RhoP15409 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RhoP15409 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RhoP15409 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RhoP15409 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RhoP15409 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RhoP15409 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RhoP15409 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RhoP15409 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RhoP15409 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RhoP15409 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RhoP15409 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RhoP15409 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RhoP15409 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RhoP15409 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RhoP15409 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RhoP15409 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RhoP15409 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RhoP15409 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RhoP15409 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RhoP15409 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RhoP15409 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RhoP15409 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RhoP15409 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RhoP15409 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RhoP15409 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RhoP15409 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RhoP15409 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RhoP15409 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RhoP15409 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RhoP15409 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RhoP15409 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RhoP15409 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RhoP15409 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RhoP15409 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RhoP15409 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RhoP15409 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RhoP15409 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RhoP15409 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RhoP15409 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RhoP15409 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RhoP15409 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RhoP15409 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RhoP15409 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RhoP15409 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RhoP15409 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RhoP15409 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RhoP15409 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RhoP15409 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RhoP15409 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RhoP15409 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RhoP15409 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RhoP15409 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RhoP15409 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RhoP15409 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RhoP15409 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RhoP15409 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RhoP15409 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RhoP15409 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RhoP15409 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RhoP15409 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RhoP15409 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RhoP15409 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RhoP15409 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RhoP15409 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RhoP15409 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RhoP15409 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RhoP15409 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RhoP15409 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RhoP15409 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RhoP15409 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RhoP15409 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RhoP15409 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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