Protein–RNA interactions for Protein: F8VPJ6

Rfx7, Regulatory factor X, 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx7F8VPJ6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rfx7F8VPJ6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rfx7F8VPJ6 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rfx7F8VPJ6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rfx7F8VPJ6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rfx7F8VPJ6 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rfx7F8VPJ6 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rfx7F8VPJ6 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rfx7F8VPJ6 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rfx7F8VPJ6 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rfx7F8VPJ6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rfx7F8VPJ6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rfx7F8VPJ6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rfx7F8VPJ6 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rfx7F8VPJ6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rfx7F8VPJ6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rfx7F8VPJ6 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rfx7F8VPJ6 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Rfx7F8VPJ6 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rfx7F8VPJ6 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rfx7F8VPJ6 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rfx7F8VPJ6 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rfx7F8VPJ6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rfx7F8VPJ6 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rfx7F8VPJ6 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rfx7F8VPJ6 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rfx7F8VPJ6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rfx7F8VPJ6 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Rfx7F8VPJ6 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Rfx7F8VPJ6 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rfx7F8VPJ6 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rfx7F8VPJ6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rfx7F8VPJ6 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rfx7F8VPJ6 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rfx7F8VPJ6 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rfx7F8VPJ6 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rfx7F8VPJ6 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Rfx7F8VPJ6 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Rfx7F8VPJ6 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rfx7F8VPJ6 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rfx7F8VPJ6 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rfx7F8VPJ6 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rfx7F8VPJ6 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Rfx7F8VPJ6 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Rfx7F8VPJ6 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rfx7F8VPJ6 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rfx7F8VPJ6 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rfx7F8VPJ6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rfx7F8VPJ6 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rfx7F8VPJ6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rfx7F8VPJ6 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rfx7F8VPJ6 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rfx7F8VPJ6 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rfx7F8VPJ6 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rfx7F8VPJ6 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rfx7F8VPJ6 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rfx7F8VPJ6 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rfx7F8VPJ6 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rfx7F8VPJ6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rfx7F8VPJ6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rfx7F8VPJ6 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rfx7F8VPJ6 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rfx7F8VPJ6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rfx7F8VPJ6 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rfx7F8VPJ6 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rfx7F8VPJ6 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rfx7F8VPJ6 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rfx7F8VPJ6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rfx7F8VPJ6 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rfx7F8VPJ6 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rfx7F8VPJ6 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rfx7F8VPJ6 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rfx7F8VPJ6 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rfx7F8VPJ6 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rfx7F8VPJ6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rfx7F8VPJ6 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rfx7F8VPJ6 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rfx7F8VPJ6 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rfx7F8VPJ6 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rfx7F8VPJ6 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rfx7F8VPJ6 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rfx7F8VPJ6 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rfx7F8VPJ6 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rfx7F8VPJ6 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rfx7F8VPJ6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rfx7F8VPJ6 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rfx7F8VPJ6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rfx7F8VPJ6 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rfx7F8VPJ6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rfx7F8VPJ6 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rfx7F8VPJ6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rfx7F8VPJ6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rfx7F8VPJ6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rfx7F8VPJ6 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rfx7F8VPJ6 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rfx7F8VPJ6 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rfx7F8VPJ6 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rfx7F8VPJ6 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rfx7F8VPJ6 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rfx7F8VPJ6 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms