Protein–RNA interactions for Protein: Q99N92

Mrpl27, 39S ribosomal protein L27, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl27Q99N92 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mrpl27Q99N92 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mrpl27Q99N92 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mrpl27Q99N92 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mrpl27Q99N92 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mrpl27Q99N92 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mrpl27Q99N92 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mrpl27Q99N92 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mrpl27Q99N92 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mrpl27Q99N92 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mrpl27Q99N92 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mrpl27Q99N92 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mrpl27Q99N92 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mrpl27Q99N92 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mrpl27Q99N92 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mrpl27Q99N92 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Mrpl27Q99N92 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Mrpl27Q99N92 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Mrpl27Q99N92 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mrpl27Q99N92 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Mrpl27Q99N92 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mrpl27Q99N92 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mrpl27Q99N92 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mrpl27Q99N92 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mrpl27Q99N92 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mrpl27Q99N92 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mrpl27Q99N92 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mrpl27Q99N92 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mrpl27Q99N92 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Mrpl27Q99N92 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mrpl27Q99N92 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mrpl27Q99N92 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl27Q99N92 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl27Q99N92 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl27Q99N92 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl27Q99N92 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Mrpl27Q99N92 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl27Q99N92 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl27Q99N92 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Mrpl27Q99N92 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl27Q99N92 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl27Q99N92 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Mrpl27Q99N92 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl27Q99N92 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl27Q99N92 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Mrpl27Q99N92 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Mrpl27Q99N92 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl27Q99N92 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Mrpl27Q99N92 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl27Q99N92 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl27Q99N92 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl27Q99N92 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl27Q99N92 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl27Q99N92 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl27Q99N92 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl27Q99N92 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl27Q99N92 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl27Q99N92 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl27Q99N92 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl27Q99N92 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl27Q99N92 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl27Q99N92 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl27Q99N92 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Mrpl27Q99N92 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl27Q99N92 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms