Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q7

Pacs2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, mousemouse

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs2Q3V3Q7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pacs2Q3V3Q7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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