Protein–RNA interactions for Protein: P59997

Kdm2a, Lysine-specific demethylase 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm2aP59997 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm2aP59997 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm2aP59997 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm2aP59997 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm2aP59997 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm2aP59997 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm2aP59997 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm2aP59997 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm2aP59997 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm2aP59997 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm2aP59997 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm2aP59997 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm2aP59997 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm2aP59997 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm2aP59997 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm2aP59997 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm2aP59997 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm2aP59997 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm2aP59997 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm2aP59997 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm2aP59997 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm2aP59997 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm2aP59997 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm2aP59997 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm2aP59997 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm2aP59997 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm2aP59997 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm2aP59997 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm2aP59997 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Kdm2aP59997 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kdm2aP59997 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kdm2aP59997 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kdm2aP59997 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kdm2aP59997 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kdm2aP59997 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kdm2aP59997 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Kdm2aP59997 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kdm2aP59997 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kdm2aP59997 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kdm2aP59997 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kdm2aP59997 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kdm2aP59997 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms